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上海生科院等首次绘制哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达图谱

信息来源:上海生命科学研究院 | 作者:admin | 时间:2016-05-23 16:53

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3月23日,国际学术期刊Genome Biology and Evolution 发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所Philipp Khaitovich研究组的研究论文“Changes in snoRNA and snRNA abundance in the human, chimpanzee, macaque and mouse brain”。该研究首次绘制了哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达图谱,发现哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达水平存在广泛差异。

snRNA和snoRNA是功能和进化保守的转录调控元件,但长期以来缺乏其在人脑转录组水平的系统研究。Philipp Khaitovich研究组与俄罗斯莫斯科大学教授Mikhail S. Gelfand合作,利用高通量测序技术系统地测定了人、黑猩猩、恒河猴和小鼠大脑前额叶皮质组织中snRNA和snoRNA的表达量,通过比较分析发现snRNA和snoRNA在基因家族水平上非常保守,但是其中U1和SNORA29表达量在人脑中却发生了巨大变化。SNORA29 在人脑中表现为特异表达缺失,并且实验发现SNORA29在非人灵长类的神经元中特异表达,提示其在人脑认知功能形成中的潜在作用。同时,该研究发现与mRNA的表达主要受启动子调控不同,二级结构稳定性是snoRNA表达调控的重要机制。

该研究是对snRNA和snoRNA在人脑进化中作用的多物种系统性研究,对于探寻人脑认知功能的分子调控机制具有重要意义。

该研究得到了国家自然科学基金委、中国科学院和俄罗斯科学基金会的资助。

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